智慧財產局為清理多年來之專利積案情形，經由政府出資協助於2012年3月15日成立財團法人專利檢索中心，並於2012年5月3日正式營運。

專利檢索中心之首任董事長由現任智慧財產局王美花局長兼任，執行長由孔繁能先生擔任，檢索中心主要分為檢索業務處和行政管理處，而檢索業務處包含機械、電機和化工共三組，目前編列約25名檢索人員，未來將逐漸擴增人員。

按以往專利申請時審查委員需檢索先前技術以判斷申請人提出之專利申請是否符合新穎性和進步性等專利要件，惟此等專利前段作業卻耗費審查委員不少之工作時間，使得審查速度減慢而造成專利積案情形。智慧財產局多年前參考日本和韓國對於專利申請案之檢索事項委外方式，而研擬出專利檢索之專責機構，以協助專利前案檢索和分類，除了可減少審查委員之工作量以加快審查速度並仍維持審查品質外，也可提供專利申請人或產業界更完整之專利資訊，促進我國之智慧財產權保護和發展，提昇我國創新研發和國際競爭力。